Центр дистанционного образования, как структурное подразделение Института развития образования Краснодарского Края, создан в октябре 2009 года на основании приказа департамента образования и науки Краснодарского края № 3255 от 16.10.2009 г. в рамках реализации приоритетного национального проекта «Образование». Центр дистанционного образования — инклюзивно-ориентированное образовательное учреждение, основной задачей которого являлось создание условий для получения качественного образования детьми-инвалидами, обучающимися на дому с использованием дистанционных образовательных технологий.
С 2013 года центр дистанционного образования расширил свои полномочия и осуществляет сопровождение не только обучения детей-инвалидов, обучающихся на дому, с использованием дистанционных образовательных технологий, но и школьников Краснодарского края.